第二部分：
深入巢穴之后，开始遇到更多更强大的虫族，包括正在孵化中的跳虫、自爆虫等。这一阶段的战斗难度逐渐提升，大部分时候必须采取正确的策略，例如要小心处理自爆虫，否则自爆虫炸裂之后大范围泼溅的酸液会对队员们造成严重伤害。
到这里，队员们开始遇到一些麻烦，需要互相帮助，但整体的心态还是比较积极的。
人工智能仍旧会指引主角做出最佳决策，听从人工智能的建议会让战斗难度明显降低。